PROTAC分子量较大、氢键较多、溶解性较差、透膜性交叉、稳定性较差等内容,需要尽早收集ADME相关数据,比如PROTAC分子在溶液中溶解度、LogD,LogP,在血浆、肠液、胃液、原代肝细胞、筛选细胞实验培养基中的稳定性等等,透膜性也是另一个重要的参数,比如测试Caco-2.MDCKII, MDCKII-MDR1等细胞系中的Papp,做细胞实验所需细胞系中的透膜能力等等;还有代谢稳定性,在肝微粒体和原代肝细胞中的稳定性等等。
结合体外的筛选平台,也可以通过靶点结合和生物标记物分子的检测,快速评价PROTAC透过肿瘤细胞的能力及与靶点的结合能力。对于脱靶效应的检测,也是非常重要,这个也受限于PROTAC的基本原理,当分子与非靶点蛋白有较弱或中等的亲和力时,也有可能带来脱靶降解,常会用到蛋白组学的方法来分析。
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