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生信分析 | 解锁Venn图画法

作者：上海阿趣生物科技有限公司 2021-10-20T16:15 (访问量:9720)

Venn图，又称韦恩图或文氏图，韦恩图用于展示在不同的事物群组(集合)之间的数学或逻辑联系，尤其适合用来表示集合(或)类之间的“大致关系”，它也常常被用来帮助推导(或理解推导过程)关于集合运算(或类运算)的一些规律。是一种用于直观表示元素集合重叠的一种图形。接下来和大家分享一下韦恩图的制作方法。

1.在线Venn图的解锁

（1）jvenn（http://jvenn.toulouse.inra.fr/app/example.html）

第一步：（界面）打开链接是这样的。

第二步：（数据输入）左侧输入数据，这里也可以导入文件，输入文件为文本文档。在输入对应组合名时，组合名不能超过11个字符。

第三步：（释义与数据导出）在上图红框中输入数据，即可得到两个数据集的交集基因，如不需要柱状图，可通过将下图红框中设置为"NO"，同时通过点击黄框中的英文即可得到图像及相应的文件。

（2）Draw Venn Diagram（http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/）

第一步：（界面）打开首页是这样的。

第二步：（数据输入）左侧输入数据，这里既可以导入文件，也可以直接输入组合的列表，如果输入框不够，可以点击"Add"添加新的输入框。右侧可填写对应组合的名称。

第三步：（数据导出）上传数据，命名好组名并点击"Submit"，即可得到结果。最后，就是下载结果。

在线Venn图小结

jvenn和Draw Venn Diagram两个Venn图网站各有优缺点。jvenn只能画少于6组的Venn图且会限制组名的长度，Draw Venn Diagram能够画大于6组的图像。

2、R语言代码Venn图的解锁

（1）首先展示一个使用R的VennDiagram包绘制常规韦恩图的方法，该包适用于2<=样本数<=5的情形。通常韦恩图所展示的样本数量不会超过5，因为当样本数量大于5时，绘图结果将难以观测。因此对于VennDiagram包来讲，它所支持的样本数量也是最多为5个。其实不止R的VennDiagram包，其它可绘制韦恩图的R包或除R外的其它绘图工具等，一般也不支持样本数大于5个的情形。

第一步：Venn图数据整理

第二步：Venn包加载及画图函数参数设置

结果展示：