通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
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iTRAQ技术是由ABI公司研发的一种多肽体外标记技术。该技术利用多种同位素试剂标记蛋白多肽N末端或赖氨酸侧链基基团，经高精度质谱仪串联分析，可同时比较多达8种样品之间的蛋白表达量。
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